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Prime Editing点突变细胞构建实验流程及应用常见问答

常见问答

QKI修复模板选择和设计?

A:在PE里面是不存在KI模版的,只需要将我们想改变的碱基序列设计在peg3’端就可以了。

 

Q:抗性浓度摸索和细胞倍增时间怎么优化?

A:因为细胞扩增时间越长,对抗生素就越敏感。我们一般会设定筛选的时间大约在细胞扩增两次的时间。

 

QPE点突变细胞构建实验一般用多少载体?

A:一般用3-4个载体,一个载体表达PE蛋白,一个载体表达pegRNAMLHDNnicksgRNA这两个载体按实验需求使用。

 

Q:载体的比例是怎样的?

A:一般是PE载体用量大一些,其次是pegRNA,然后是MLHDNnicksgRNA,因为PE载体比较大,也是实验的主要元件,所以用量会多一些。具体比例根据细胞而异。

 

Q:一般会设计几个PE

A:根据位点情况一般设计2-3组,然后根据RBS长度,PBS长度,RTT长度去选择最优的PE

 

Q:多克隆测序分析工具有哪些?

A:①Synthego ICE Analysis Tool TIDE


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