【前沿资讯】CRISPR技术新动态--CRISPR/Cas9基因敲除细胞技术助力开发消融癌细胞新方法
一、研究资讯：
（一）CRISPR 基因敲除细胞
中国科学院上海硅酸盐研究所的研究人员近期开发了一种磁热诱导的CRISPR-Cas9基因编辑系统，用于靶向敲除HSP70和BCL2基因，作为一种消融癌细胞而不伤害附近健康细胞的新方法。磁热纳米颗粒平台允许质粒DNA上样，在可控交变磁场的感应下，温和的磁热效应（42℃）不仅触发双基因组编辑破坏肿瘤细胞的凋亡抵抗机制，而且通过热效应本身使肿瘤细胞对凋亡敏感，达到协同治疗效果。这项研究最近以“Magnetothermal-activated gene editing strategy for enhanced tumor cell apoptosis”为名发表在《Journal of Nanobiotechnology》上。
原文链接：https://doi.org/10.1186/s12951-024-02734-8
（二）CRISPR文库筛选
剪接因子 RNA 结合基序蛋白 10 （RBM10） 的功能丧失突变在肺腺癌 （LUAD） 中很常见。这些通常与肿瘤发生增加相关，这限制了当前 LUAD 靶向疗法的疗效，但利用 RBM10 缺乏症的治疗策略仍未得到探索。为了探索RBM10作为LUAD治疗靶点的潜力，以色列的一个团队进行了CRISPR-Cas9合成致死性筛选，确定了约60个RBM10 SL基因，包括WEE1激酶。他们发现，WEE1抑制在体外和体内使RBM10缺陷的LUAD细胞敏感，进一步的表征表明RBM10在微调DNA复制中的作用。该研究结果发表在《Nature Communications》上，表明有可能靶向RBM10缺陷的肿瘤。
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-024-50882-0
（三）点突变
认识到脱氨酶衍生的DNA碱基编辑器不能直接编辑胸腺嘧啶和鸟嘌呤的局限性，北京大学的研究人员报告了通过尿嘧啶-DNA糖基化酶（UNG）工程利用翻译DNA合成途径编辑胞嘧啶和胸腺嘧啶的碱基。7月30日，他们在《Nature Communications》发表的一篇文章的指出，当与切口酶Cas9融合时，一种经过工程化的Deinococcus radiodurans UNG突变体（称为DrUNG）促进了内源性的胸腺嘧啶碱基的高效编辑，在不富集的情况下达到55%的编辑效率，并表现出最小的细胞毒性。该团队还证明，这种新型碱基编辑器可以恢复来自Hurler综合征患者的细胞中的IDUA酶活性。
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-024-50012-w
（四）CRISPR检测
1、为了将商业甲胎蛋白 （AFP） 条带重新用于核酸样本的超灵敏和手持式检测以进行诊断，哈尔滨工业大学研究人员提出了一种核酸外切酶III/CRISPR -Cas12a（Exo-III / Cas12a）级联扩增策略与基于智能手机的便携式荧光检测器（SPFD）相结合的核酸检测策略。该团队所提出的平台对 miRNA-155、金黄色葡萄球菌的 16S rRNA 和 Covid-19 假病毒的 ORF1a/b RNA 具有低检测限。研究结果于近期发表在《Analytical Chemistry》杂志上。
原文链接：https://doi.org/10.1021/acs.analchem.4c02366
2、新加坡的一个研究小组报告了一种整合了 CRISPR-Cas12a 的一锅式近距离等温免疫分析法，用于同质蛋白质目标检测。在他们的设置中，由与寡核苷酸偶联的不同结合剂组成的探针在与蛋白质靶标结合时会发生双向延伸，导致一对切口酶和聚合酶对下游 DNA 扩增，从而生成用于产生Cas12a 信号的靶序列。他们利用链霉亲和素-生物素模型证明，蛋白质检测的所有三个要素（靶蛋白结合、DNA 扩增和 Cas12a 信号生成）可以在一锅中共存，并在 10 μL 低反应体积下的单个缓冲系统中等温进行。他们使用四种不同的蛋白质靶标验证了他们的工作流程，检测限范围从 fM 到 pM。相关研究结果发表在《ACS Sensors》上。
原文链接：https://doi.org/10.1021/acssensors.4c00370
（五）其他
1、青光眼是一种无法治愈的疾病，影响着全球约 8000 万人。青光眼发生的主要危险因素是眼压升高，这是由房水分泌和流出之间的平衡决定的。最近，英国和中国的科学家发表在《Nature Communications》上的一篇文章表明，RNA干扰工具CasRx可以降低雌性小鼠房水循环相关基因Rock1和Rock2的表达，以及水通道蛋白1和β2肾上腺素能受体的表达。该策略显着降低了雌性小鼠的眼压，为视网膜神经节细胞提供了保护，并减缓了疾病进展。
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-024-50050-4
2、以色列的科学家开发了一种深度学习模型--DeepCRISTL，可用于预测特定细胞环境中的编辑效率。新工具使用高通量数据集来学习gRNA编辑效率的一般模式，然后根据功能性或内源性数据对模型进行微调，以适应特定的细胞环境。该团队测试了在高通量数据集上训练的两个最先进的模型（DeepHF和CRISPRon），这些模型结合各种迁移学习方法进行编辑效率预测，发现CRISPRon和微调所有模型权重的组合总体表现最好。他们的研究结果于本周早些时候发表在《生物信息学》杂志上。
原文链接：https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btae481
二、行业新闻
1、Intellia Therapeutics近期宣布，英国药品和保健产品监管机构已经批准了NTLA-3001的临床试验申请，NTLA-3001是一种基于CRISPR的体内治疗候选药物，正在开发中，用于治疗α-1抗胰蛋白酶缺乏症。
2、Cellectis 于8月1日宣布，FDA已授予CLLS52（alemtuzumab）孤儿药资格，CLLS52是一种研究性医药产品，用作与Cellectis的治疗候选药物UCART22相关的淋巴细胞清除方案的一部分，在BALLI-01临床试验中对复发/难治性B细胞急性淋巴细胞白血病进行了评估。
3、AIRNA是一家为罕见病和常见疾病提供RNA编辑疗法的先驱生物技术公司，最近宣布已完成一轮超额认购的6000万美元融资，使该公司的A轮融资总额达到9000万美元。根据新闻稿，由Forbion牵头的A轮融资所得款项将用于推进AIRNA的α-1抗胰蛋白酶缺乏症主要候选产品进入临床试验，并进一步开发AIRNA的广泛产品线。
4、Precision Biosciences在8月1日发布的新闻稿中报告了其2024年第二季度财务业绩和业务更新。其中一项更新是，该公司的全资项目PBGENE-HBV治疗慢性乙型肝炎病毒和PBGENE-PMM治疗m.3243线粒体疾病，分别于2024年和2025年在美国和欧盟提交临床试验申请。
5、Vertex Pharmaceuticals 8月1日公布了 2024 年第二季度财务业绩。该公司披露，其有足够的资金来实现多个体内基因编辑项目的1期临床数据，预计现金流将持续到2026年下半年。该公司还报告说，它已经重新获得了三个先进的临床前项目控制权，用于内部或与合作伙伴一起开发，包括一种针对杜氏肌营养不良症的新型基因编辑方法。
艾迪基因专注于CRISPR技术，提供一系列高质量的基因编辑服务和体外诊断产品：CRISPR文库筛选、细胞基因编辑、单克隆筛选、CRISPR检测。致力于为CRISPR相关、基因功能研究相关、体外诊断以及治疗相关的科学研究提供最高效的技术服务。
近期资讯
1.【文献解读】CRISPR-Cas12a表现出金属依赖的特异性转换2.【文献解读】CRISPR KO筛选助力开发眼镜蛇毒液咬伤的潜在解毒剂
3.【文献解读】Cas12a结构域的灵活性指导R-loop的形成并强制RuvC复位
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