【一周时讯】CRISPR家族新成员：VII型CRISPR-Cas系统为基因编辑带来新突破！
CRISPR/Cas系统是现代生物科学领域的一项革命性技术，其应用已经扩展到医学、农业、生态保护等多个领域，相关成果和应用实例不断涌现。CRISPR那些事儿设置一周时讯栏目，为您带来关于CRISPR的最新研究和行业新闻，以下是过去一周时讯的简单总结：
一、研究资讯
（一）CRISPR基因敲除细胞
1. 文章题目：CRISPR-Cas9-mediated genome editing delivered by a single AAV9 vector inhibits HSV-1 reactivation in a latent rabbit keratitis model
期刊：Molecular Therapy Methods & Clinical Development（IF:4.7）
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.omtm.2024.101303
单纯疱疹病毒1（HSV-1）角膜炎是导致失明的主要原因，尤其是在发达国家。近期，来自美国的研究人员评估了基于CRISPR-Cas9介导的基因组编辑的候选药物EBT-104的治疗潜力。研究人员设计了四种靶向HSV-1中ICP0和ICP27基因的gRNA，选出了效果最显著的一对（ICP0g2/ICP27g1，即SaCas9-g2g1），并在评估后将其结合到一体式AAV9载体中。该载体通过角膜结疤和静脉注射的方式在潜伏期HSV-1角膜炎兔模型中进行了测试。研究发现，单剂量AAV9一体式CRISPR-Cas9基因编辑能够有效靶向潜伏期HSV-1，抑制病毒再次激活。这种新型CRISPR-Cas9基因编辑疗法在细胞和兔子模型中都能有效降低病毒载量，并抑制病毒再次激活，证明了其作为HSV-1角膜炎治疗方法的巨大潜力。
2. 文章题目：Beyond CAR-T: The rise of CAR-NK cell therapy in asthma immunotherapy
期刊：Journal of Translational Medicine (IF:6.1)
原文链接：https://doi.org/10.1186/s12967-024-05534-8
哮喘是一种慢性气管炎症性疾病，影响着全球数百万人，然而，目前主要的疗法却只治标不治本。CAR-NK 细胞疗法作为一种免疫疗法，为治疗哮喘提供了一种更开阔的新思路。为了研究 CAR-NK 细胞靶向消除哮喘相关炎症细胞的机制，伊朗的研究人员提出了一种CRISPR 介导的基因编辑与人工智能相关的方案用于治疗哮喘。临床前研究表明，CAR-NK 细胞在动物模型中对减少气管炎症和改善哮喘肺功能方面具有显著疗效。这些研究结果表明，CAR-NK 细胞可能调节哮喘患者的免疫反应。然而，克服脱靶效应和免疫相关不良反应对于长期治疗的安全性和有效性至关重要。随着CRISPR基因编辑技术的进步，CAR-NK细胞疗法将成为一种极有潜力的哮喘治疗方法。
（二）CRISPR筛选
1. 文章题目：Removal of TREX1 activity enhances CRISPR-Cas9-mediated homologous recombination
期刊：Nature Biotechnology - Nature (IF:33.1)
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41587-024-02356-3
作为一种外切酶，TREX1通常是免疫系统中检测细胞膜DNA的抑制剂。为了研究TREX1在CRISPR-Cas9介导的同源定向修复（HDR）中的作用及其提高基因组编辑效率的潜力，苏黎世联邦理工学院和纽约纪念斯隆-凯特琳癌症中心的研究人员在范可尼贫血症（FA）患者的淋巴母细胞系中进行了一次全基因组CRISPR筛选。研究发现，TREX1通过降解修复模板抑制了HDR的效率。通过在人类细胞和FA患者衍生细胞中敲除TREX1，研究者发现这样做可以稳定单链或线性化双链DNA，提高它们在HDR过程中的结合率。这些研究表明，抑制TREX1可以稳定修复模板以及提高HDR率，从而显著提高基于CRISPR-Cas9的基因编辑效率。TREX1是模板保护的一个重要而显著的生物标志物，在推进CRISPR治疗策略中具有巨大潜力。
（三）其他CRISPR技术
1. 文章题目：Structural basis for the activity of the type VII CRISPR-Cas system
期刊：Nature (IF:50.5)
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41586-024-07815-0
近期，我国的研究人员报道了一种新型CRISPR系统VII型，并阐明了其结构和功能。该系统利用由Cas5、Cas7和Cas14蛋白组成的复合体来靶向和切割RNA，其中Cas14是Cas5-Cas7复合体与靶RNA结合后被招募到Cas5-Cas7复合体中的关键酶。Cas14在N端直接切割RNA，而在C端则锚定到其他蛋白质上。研究人员利用低温电子显微镜捕捉到了这一复合体的详细活动图像，发现Cas14可以与Cas5-Cas7复合体上的多个位点结合，从而对RNA进行多次切割。RNA 的切割效率受目标RNA序列的影响，尤其是5'端。这项研究为了解VII型CRISPR的功能提出了重要的见解，并为开发基于CRISPR的新型切割工具打下良好基础。
2. 文章题目：Precision epigenetic editing: Technological advances, enduring challenges, and therapeutic applications
期刊：Cell Chemical Biology-Cell Press (IF:6.6)
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2024.07.007
这篇综述讨论了精准表观遗传编辑的进展、持久挑战和治疗应用。研究人员全面回顾了目前有关表观遗传编辑工具的文献，并根据表观遗传调控的几个层次对现有技术进行了分类。他们还讨论了将核酸酶活化的Cas与表观遗传效应结构域融合，作为靶向表观遗传编辑的技术基础。该综述强调了表观遗传编辑工具开发方面的重大进展，其中基于CRISPR的系统已成为一种通用的可重编程平台。CRISPRi和CRISPRa等工具分别为靶向基因下调和上调打下基础。此外，与dCas蛋白融合的新型结构域扩大了可写表观遗传标记的范围，并增强了基因表达折叠变化。这些工具已被应用于疾病治疗，展示了表观遗传编辑的巨大潜力。
3. 文章题目：Quantitative analysis of electroporation-mediated intracellular delivery via bioorthogonal luminescent reaction
期刊：Communications Chemistry - Nature (IF:5.9)
原文链接：https://doi.org/10.1038/s42004-024-01266-4
高效的细胞内递送对许多生物医学应用至关重要，然而，量化细胞内的递送分子却始终存在着挑战。为了解决这个问题，来自芬兰和荷兰的研究人员设计了一种生物杂交发光反应（BioLure分析法），这是一种量化细胞内分子的简单而可靠的方法。研究者利用电穿孔技术将生物发光探针送入细胞，并测量发光强度以估算送进细胞内的分子数量。BioLure分析法与其他量化细胞内递送分子的成熟方法有很强的相关性，它成功地量化了递送到细胞内的 RNase A的数量，并将其与细胞的抗肿瘤活性联系起来。BioLure方法为评估细胞内递送效率和优化递送参数提供了一种宝贵的工具。它适用于量化各种治疗分子和细胞类型，有助于开发更有效的药物递送系统。量化细胞内递送对于了解递送物质与疗效之间的相关性至关重要。通过使用BioLure方法量化细胞内递送，研究人员可以优化递送效率，最大限度地发挥生物治疗相关应用的潜力，如CRISPR-Cas基因编辑工具等。
二、行业新闻
1. 本周，Fate Therapeutics公司公布了2024年第二季度财务报告，并提供了最新业务信息。主要包括FT819治疗自身免疫性疾病的1期试验正在进行，B细胞淋巴瘤1期试验无调理组的首例患者已开始用药。公司报告的现金额为3.52亿美元，试验期限延长至2026年底。
2. 上周，Vor Bio公司公布了2024年第二季度财务报告，并提供了最新业务消息。该公司正在迅速招募急性髓性白血病（AML）1/2 期 trem-cel 试验的患者，迄今已有21名患者接受了治疗。Trem-cel是一种针对CD33抗原的CRISPR编辑细胞疗法，目前正与Mylotarg联合应用。该公司预计将在2024年下半年提供有关移植、血液学保护数据以及Mylotarg药代动力学数据的最新信息。
3. Iovance Biotherapeutics公司公布了2024年第二季度财务报告，并提供了最公司消息。
艾迪基因专注于CRISPR技术，提供一系列高质量的基因编辑服务和体外诊断产品：CRISPR文库筛选、细胞基因编辑、单克隆筛选、CRISPR检测。致力于为CRISPR相关、基因功能研究相关、体外诊断以及治疗相关的科学研究提供最高效的技术服务。
近期资讯
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