【一周时讯】CRISPR-Cas9 筛选技术助力打破二维细胞培养模型中的功能基因组筛选限制！
CRISPR/Cas系统是现代生物科学领域的一项革命性技术，其应用已经扩展到医学、农业、生态保护等多个领域，相关成果和应用实例不断涌现。CRISPR那些事儿设置一周时讯栏目，为您带来关于CRISPR的最新研究和行业新闻，以下是过去一周时讯的简单总结：
一、研究资讯
（一）CRISPR筛选
1、文章题目: In vivo CRISPR screens identify a dual function of MEN1 in regulating tumor–microenvironment interactions
期刊： nature genetics （IF:31.7）
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41588-024-01874-9
二维细胞培养模型中的功能基因组筛选在识别影响肿瘤微环境的治疗靶点方面受到限制。对此，来自加拿大多伦多大学、牛津大学和我国上海市肺科医院、四川大学的研究人员比较 2D 细胞培养物和异种移植物的 CRISPR-Cas9 筛选发现 ，MEN1 是具有肿瘤微环境依赖性作用的关键基因。MEN1 敲除显示对体外增殖没有影响，但会改变小鼠的肿瘤生长，在免疫缺陷模型中促进免疫缺陷的生长，而在免疫功能正常的模型中抑制了免疫缺陷的生长。从机制上讲，MEN1 缺失通过重新分配 MLL1 和 H3K4me3 激活免疫通路，增强免疫细胞浸润并抑制 menin-MLL 相互作用，从而减少了肿瘤生长，突出了 MEN1 是实体癌的潜在靶点。
2、文章题目：MIG6 loss increased RET inhibitor tolerant persister cells in RET-rearranged non-small cell lung cancer
期刊：Cancer Lett.（IF:9.1）
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.canlet.2024.217220
RET酪氨酸激酶抑制剂（TKIs）ET对重排非小细胞肺癌 （NSCLC） 或 RET 突变甲状腺癌具有良好治疗效果，但耐药性的发展限制了长期疗效。尽管已知许多RET-TKI耐药机制，一些原发性或获得性耐药机制尚不清楚。对此，一组来自日本的研究者通过人类基因组范围的CRISPR/Cas9筛选，鉴定了与药物耐受持续存在细胞相关的基因。使用RET融合的患者来源细胞，引入基因组范围的sgRNA库，并用RET-TKI处理9天，发现了多个候选基因。MED12或MIG6的敲除显著增加了在RET-TKI处理下的残余药物耐受持续存在细胞。
（二）CRISPR检测
1、文章题目：Fast and sensitive detection of viable Escherichia coli O157:H7 using a microwell-confined and propidium monoazide-assisted digital CRISPR microfluidic platform
期刊：Lab on a Chip（IF:6.1）
原文链接：https://doi.org/10.1039/D4LC00672K
大肠杆菌O157：H7 是一种主要的食源性病原体，对食品安全和人类健康构成重大威胁。浙江大学的研究人员提出了一种基于CRISPR 的微流控平台，可快速、灵敏地检测食品样品中的活大肠杆菌 O157：H7，并在 5 分钟内提供结果。通过使用单叠氮化丙啶排除死细胞和直接裂解方法，它在 30 分钟内达到 36 CFU/mL 的检测限，为食品安全检测提供了一种有力工具。
2、文章题目：One-base-mismatch CRISPR-based transistors for single nucleotide resolution assay
期刊：Biosensors and Bioelectronics（IF:10.7）
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.bios.2024.116548
近期，复旦大学和上海海关的研究人员提出了一种基于 CRISPR-Cas13a 的晶体管生物传感器，用于快速、高选择性地检测病毒 RNA 中的单核苷酸变异 （SNV）。通过利用工程化的 crRNA 和石墨烯通道，生物传感器在无需靶标扩增的情况下即可检测 RNA，检测限达到 5 拷贝/100 μL 。它可以在15分钟内区分野生型 RNA 和 SNV RNA，为病毒诊断（包括流感和 SARS-CoV-2 变体）提供了一种灵敏、可现场部署的工具。
（三）其他CRISPR相关研究
1、文章题目：Diverse viral cas genes antagonize CRISPR immunity
期刊：nature（IF:50.5）
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41586-024-07923-x
美国华盛顿大学的研究人员调查李斯特菌分离株发现了15个新的抗 CRISPR （Acr） 基因家族，这些基因家族通常通过 Cas 蛋白共同作用来抑制 CRISPR-Cas 免疫。值得注意的是，I-B 型 Cas 蛋白的一个同源物通过降解 crRNA 意外地抑制了靶向 RNA 的 VI 型系统。此外，还鉴定出一种广谱 Cas3 同源物，可抑制多个 CRISPR 系统。
2、文章题目：Immunoliposome-based targeted delivery of the CRISPR/Cas9gRNA-IL30 complex inhibits prostate cancer and prolongs survival
期刊： experimental & molecular medicine（IF:9.5）
原文链接：https://doi.org/10.1038/s12276-024-01310-2
意大利科学家已经证明了靶向 CRISPR-Cas9 递送系统在抑制前列腺癌 （PC） 肿瘤生长和转移方面的潜力。在该研究中，通过使用与抗前列腺干细胞抗原 （PSCA） 抗体偶联的脂质纳米复合物，研究人员将靶向免疫抑制白细胞介素 30 （IL30） 基因的 CRISPR-Cas9 系统特异性地递送到 PC 细胞。
3、文章题目：Codon usage and expression-based features significantly improve prediction of CRISPR efficiency
期刊：npj systems biology and applications（IF:3.5）
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41540-024-00431-8
以色列特拉维夫大学研究人员在一项研究中引入了基于密码子使用偏差 （CUB） 和基因表达的新预测特征，这些功能显著提高了 CRISPR 效率预测的准确性。通过将这些功能整合到现有的预测模型中，该研究增强了模型预测不同细胞类型中 CRISPR 编辑有效性的能力。
二、行业新闻
1、Chroma Medicine 在2024年欧洲心脏病学会大会上展示了其 PCSK9 靶向表观遗传编辑器的临床前数据。数据显示，非人灵长类动物的PCSK9和低密度脂蛋白胆固醇水平在没有 DNA 切割的情况下有效、持久地降低，低密度脂蛋白胆固醇降低68%，持续长达三个月。
2、Caribou Biosciences 的CRISPR编辑CAR-T疗法CB-010 和CB-012 已获得 FDA 快速通道认证。CB-010 靶向难治性系统性红斑狼疮，将于2024年底进入1期试验，而针对复发或难治性急性髓性白血病的CB-012正在进行试验。这两种疗法都为具有重大未满足需求的疾病提供现成的治疗选择，可能会加快其获得批准的速度。
3、YolTech Therapeutics 的 YOLT-203 已获得 FDA 罕见儿科疾病认定，YOLT-203 是一种用于治疗 1 型原发性高草酸尿症 （PH1） 的体内基因编辑疗法。使用 YolTech 的 YolCas12™ CRISPR-Cas 系统，YOLT-203 靶向并纠正 AGXT 基因突变，以减少肾脏中有害的草酸盐积累。不久前，他们报道了前两名患者已在 YOLT-203 的 1 期试验中给药。
艾迪基因专注于CRISPR技术，提供一系列高质量的基因编辑服务和体外诊断产品：CRISPR文库筛选、细胞基因编辑、单克隆筛选、CRISPR检测。致力于为CRISPR相关、基因功能研究相关、体外诊断以及治疗相关的科学研究提供最高效的技术服务。
近期资讯
1.【文献解读】 CRISPR基因敲除细胞技术助力肾病治疗：激活Nrf2，开启肾脏保护新篇章2.【一周时讯】Cas酶结构新突破：NlaCas3 I-C 型 Cas3 酶的第一个结构被揭示！
3.【文献解读】CRISPR筛选助力发现多发性骨髓瘤治疗的关键靶点
联系我们
18102225074（微信同号）
market@edgene.cn