LbCas12a属于2类V型CRISPR效应蛋白,是一种依赖crRNA介导的核酸内切酶,在靶标双链DNA存在PAM(TTN)序列的情况下,由crRNA介导特异性识别并切割双链DNA.
LbCas12a Nuclease说明书
【产品名称】LbCas12a Nuclease 【分子量】146.8 KDa
【产品编号】EDE0005 【形式】液体
【产品简介】
LbCas12a(又名Cpf)核酸酶来源于Lachnospiraceae bacterium ND2006 菌株。LbCas12a属于2类V型CRISPR效应蛋白,是一种依赖crRNA介导的核酸内切酶,在靶标双链DNA存在PAM(TTN)序列的情况下,由crRNA介导特异性识别并切割双链DNA,而LbCas12a 特异性切割靶标单链DNA不依赖PAM序列。同时,LbCas12a-crRNA复合物与互补单链DNA或者双链DNA结合后,其非特异性ssDNA反式切割活性被激活,通过设计两端标记荧光基团或其它小分子标记的单链Reporter DNA,可实现Cas12a对DNA模板的检测和信号放大。可通过荧光仪和试纸条观察结果。
【产品组分】
组分 |
EDE0005-100 |
EDE0005-1000 |
EDE0005-2000 |
LbCas12a Nuclease |
1 μM*100 μL(100 pmol) |
1 μM*500 μL*2管(1000 pmol) |
1 μM* 500 μL*4管(2000 pmol) |
LbCas12a Cleavage Buffer(10×) |
500 μL*1管 |
1mL*4管 |
1mL*7管 |
【储存条件及有效期】
有效期1年,保存条件-20°C;如长期储存,建议置于-80°C。
建议根据使用次数进行分装,避免反复冻融。
【产品特点】
采用一步法纯化制备,最大程度保留酶活性,经过酶活性测试显著高于同类产品。
【活性定义】
在总体积为30 μL的反应体系中,37°C反应条件下,1 min内剪切1 pmol ssDNA探针所需的Cas12a酶量定义为1 transU。
例:若某批次LbCas12a酶的反式切割活性为30 transU/pmol,则表明1 pmol 的该批次 LbCas12a 酶可在1 min内,在上述指定的反应条件下,反式切割30 pmol的ssDNA探针。
【质量保证】
样品纯度:~95% (SDS-PAGE鉴定)。
【检测步骤】
需要准备的其它试剂
1. Reporter:Cas12a切割底物。即在剪切反应体系中加入ssDNA报告探针,该探针5′端标记荧光报告基团(FAM),3′端标记荧光淬灭基团(BHQ1)。可搭配我司的Reporter进行检测,或自行设计合成 Reporter。
产品名称 |
编号 |
ssDNA reporter(DNA探针) |
EDD0001 |
2. crRNA/gRNA:与 Cas12a 结合,形成功能复合物,被目标序列特异性激活。可选择我司的crRNA或自行设计合成crRNA。
名称 |
规格 |
编号 |
crRNA生物合成 |
2OD |
EDR0002 |
crRNA化学合成 |
2OD |
EDR0003 |
免费设计咨询:info@edgene.cn
3. 恒温扩增反应试剂盒,RPA扩增试剂盒。
【测试反应体系】
组分 |
体积/ μL |
终浓度 |
10×Cleavage Buffer |
3 |
1× |
1 μM LbCas12a Nuclease |
1 |
33 nM |
500 nM crRNA |
2 |
33 nM |
2 μM ssDNA Reporter |
6 |
400 nM |
1 μM DNA target |
0.1 |
3.5 nM |
DEPC H2O |
|
|
Total |
30 μL |
30 μL |
【反应条件】
使用实时荧光定量PCR仪或恒温扩增仪检测荧光信号,37℃反应,每30 sec采集一次荧光信号。
【实验结果】
Fig 1. Results of Cas12a collateral cleavage at different company product.
横坐标为反应时间,纵坐标为 Bio-rad CFX96荧光PCR仪检测结果。由图可见,相同的条件下,可见本品切割效率显著高于同类产品。
拍照示例
【注意事项】
1. 为防止RNase污染,请保持实验区干净整洁,操作时需穿戴干净的手套、口罩,实验所用枪头、离心管等耗材均为RNase-free。
2. Cas12a 酶对热敏感,容易失活,应全程冰上配置反应体系,并在使用后立即将酶置于-20℃保存。