基因编辑用酶的定制开发
Cas核酸酶是CRISPR-Cas系统的核心组成部分,是一类RNA引导的核酸内切酶。Cas核酸酶利用向导RNA精确识别目标核酸,随后高效地切割目标核酸分子。在众多Cas酶中,Cas9、Cas12a和Cas13a等,因其卓越的性能,在基因编辑和体外诊断等多个领域已经得到了广泛的应用。
服务详情
应用领域 | 1、基因编辑 2、CRISPR检测 |
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周期/价格 | 在线咨询 |
艾迪基因积累了多年的Cas酶开发经验和搭建了成熟的蛋白表达纯化平台,可提供基因编辑用酶的定制服务。利用软件辅助设计和优化基因编辑用酶,并采用自主研发的Fish/Bait一步纯化技术,简化了蛋白纯化流程,显著提高了目标蛋白的回收率和纯度,确保了编辑用酶的高活性。
服务优势
多年基因编辑经验
根据客户需求定制基因编辑用酶
多年CRISPR检测经验
根据客户需求定制CRISPR检测用酶
交付灵活
多种类多规格可选
技术路线
已开发产品种类/类型
Spcas9 | Lbcas12a | Aapcas12b | Lbucas13a | Lwacas13a | |
---|---|---|---|---|---|
PAM/PFS | 5’-NGG-3’ | 5’-TTTV-3’ | 5’-TTN-3’ | None | None |
None | dsDNA | dsDNA or ssDNA | dsDNA or ssDNA | ssRNA | ssRNA |
Cis-cleavage | dsDNA | dsDNA or ssDNA | dsDNA or ssDNA | ssRNA | ssRNA |
Trans-cleavage | None | ssDNA | ssDNA | ssRNA | ssRNA |
SpCas9是一种依赖于sgRNA引导的 DNA内切核酸酶。在靶标DNA存在PAM(5’-NGG-3’)的情况下,SpCas9 Nuclease能在sgRNA引导下特异性结合并切割靶标dsDNA,使DNA双链断裂并生成平末端。其切割位点位于目标序列target sequence内,距离PAM 3个碱基的位置。SpCas9不仅可用于基因编辑,还可应用于体外靶标 DNA 的切割、目的片段的克隆等实验。
LbCas12a是一种依赖crRNA介导的核酸内切酶,在靶标双链DNA存在PAM((5’-TTTV-3’)序列的情况下,LbCas12a能在crRNA介导下特异性识别并切割双链DNA,而LbCas12a 特异性切割靶标单链DNA不依赖PAM序列。LbCas12a-crRNA复合物与互补dsDNA或ssDNA结合后,其非特异性ssDNA反式切割活性被激活,通过设计两端标记荧光基团或其它小分子标记的Reporter ssDNA,可实现Cas12a对DNA模板的检测和信号放大,可通过荧光仪和试纸条观察结果。
AapCas12b核酸酶是一种依赖 sgRNA介导的核酸内切酶,在靶标双链DNA存在PAM(5’-TTN-3’)序列的情况下,由sgRNA介导特异性识别并切割双链DNA,而AapCas12b特异性切割靶标单链DNA则不依赖PAM序列。AapCas12b-crRNA复合物与互补的dsDNA或者ssDNA结合后,其非特异性ssDNA反式切割活性被激活。AapCas12b的最佳反应温度为60℃,因此适合与环介导等温扩增(LAMP)联用。
LbuCas13a是一种由crRNA介导的核酸内切酶,对PAM(PFS)位点无依赖性。在crRNA识别并切割靶标RNA时,Lbucas13a的反式切割活性被激活,可非特异切割体系中单链 RNA(ssRNA)。通过设计两端标记荧光基团或者其他标记物的RNA探针,可实现对RNA模板的检测和信号放大,可通过荧光仪或试纸条观察结果。
LwaCas13a是一种由crRNA介导的核酸内切酶,与LbuCas13a一样,对PAM(PFS)位点无依赖性。在crRNA识别并切割靶标RNA时,Lwacas13a的反式切割活性被激活,可实现对体系中的ssRNA的非特异切割。通过设计两端标记荧光基团或者其他标记物的RNA探针,可实现CRISPR/Cas13a对RNA模板的检测和信号放大。可通过荧光仪或试纸观察结果。
数据案例
通过活性测试,对比艾迪基因提供的基因编辑用酶与竞品的性能。
反应体系中添加待检Target模板、Cas酶、crRNA和荧光探针,当crRNA与Cas酶组装成功能复合物并识别Target模板后,会激活Cas酶的反式切割活性并切割荧光探针释放出荧光信号,通过荧光值来反映酶的性能。左图和右图是分别针对Lbucas12a和Lwacas3a两种酶进行测试,结果显示,艾迪基因提供的酶的荧光强度更强,切割活性与灵敏性明显更优。
Advantage and Characteristic
Optimazied Strategy
We have create a unique sgRNA Design Logic
Optimazied Strategy
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We have create a unique sgRNA Design Logic
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FAQ
一般CRISPR相关试剂以及Cas蛋白可以存放多久?
CRISPR检测相关试剂:
①RPA恒温扩增试剂盒于-20℃保存,可长期存放。
②靶标质粒可长期存放-20℃ ③ Cas蛋白反复冻融容易影响活性,建议分装多管,存放-80℃,根据实验需要取出使用。另外,短期内使用的,可放-20℃保存。
③crRNA容易降解,建议短时间内用不到的于-80℃保存。
④探针是DNA双链,相对来说没有那么容易降解,可放-20℃保存。
①RPA恒温扩增试剂盒于-20℃保存,可长期存放。
②靶标质粒可长期存放-20℃ ③ Cas蛋白反复冻融容易影响活性,建议分装多管,存放-80℃,根据实验需要取出使用。另外,短期内使用的,可放-20℃保存。
③crRNA容易降解,建议短时间内用不到的于-80℃保存。
④探针是DNA双链,相对来说没有那么容易降解,可放-20℃保存。
Cas9、Cas12和Cas13三者之间有什么区别?
Cas9、Cas12和Cas13三者的主要区别在于作用过程有差异:
Cas12与guide RNA、target DNA结合后会被激发针对ssDNA的反式剪切活性;Cas13与guide RNA、target RNA结合后会被激发针对ssRNA的反式剪切活性;而Cas9暂未被报道反式剪切活性。
Cas12与guide RNA、target DNA结合后会被激发针对ssDNA的反式剪切活性;Cas13与guide RNA、target RNA结合后会被激发针对ssRNA的反式剪切活性;而Cas9暂未被报道反式剪切活性。
dsDNA靶标和ssDNA靶标均能激活Cas12a的反式剪切活性吗?哪种效率更高?
双链DNA靶标和单链DNA靶标均能激活Cas12a的反式剪切活性(trans-cleavage,又名collateral cleavage),这点与Cas12b相同。但不同的是,ssDNA靶标激发Cas12b反式活性的效率高于dsDNA靶标;而dsDNA靶标激发Cas12a反式活性的效率高于ssDNA靶标。